FCI Tallinn II er reserve- eller B-laget til FCI Tallinn. Klubben spiller i Esiliiga B, den tredje højeste række i estisk fodbold. Holdet har base i Tallinn, Estlands hovedstad.

FCI Tallinn II blev grundlagt i 2016 som en feederklub for FCI Tallinns førstehold. Klubbens primære mål er at udvikle unge spillere og give dem mulighed for at opnå førsteholdserfaring.

Holdet har præsteret solidt i Esiliiga B og har ofte været med i toppen af tabellen. I 2020 sikrede de sig oprykning til Esiliiga, den næstbedste række i Estland.

FCI Tallinn II spiller sine hjemmekampe på Lasnamäe jalgpallikeskus, som også er førsteholdets hjemmebane.

Klubbens farver er blå og hvid, og deres logo er en stiliseret ørn med bogstaverne "FCI" skrevet på brystet.