Msida St. Joseph Fotballklubb er en maltesisk fotballklubb fra byen Msida. Klubben ble grunnlagt i 1906 og spiller sine hjemmekamper på Ta' Qali National Stadium.

Msida St. Joseph har vunnet den maltesiske serien to ganger, i 1946 og 1985. Klubben har også vunnet den maltesiske cupen tre ganger, i 1934, 1935 og 1982.

I europeisk fotball har Msida St. Joseph deltatt i UEFA-cupen og UEFA Intertoto Cup. Klubbens beste resultat i europeisk fotball er å nå andre runde av UEFA Intertoto Cup i 1984.

Msida St. Joseph har vært en del av den øverste divisjonen i maltesisk fotball siden 1945. Klubben sliter imidlertid med å holde seg i øverste divisjon, og har vært nede i andre divisjon flere ganger.

Msida St. Joseph er en av de mest tradisjonsrike klubbene på Malta, og har en stor supporterbase. Klubbens supportere er kjent som "Redbugs".